Які формати файлів відкриваються в нашому переглядачі МРТ та рентгену коліна

Формати архівів

Якщо ваш знімок надійшов у вигляді одного великого стисненого файлу, перетягніть його безпосередньо у переглядач — ми розпакуємо його у вашому браузері.

• ZIP — найпоширеніший формат на дисках лікарень та у завантаженнях із порталів пацієнтів
• TAR — поширений формат для наукових наборів даних
• .tar.gz та .tgz — стиснення TAR + GZIP

Синтаксиси передачі DICOM

Технічний формат, що використовується для кодування піксельних даних у файлі DICOM. Наш переглядач декодує кожний поширений синтаксис передачі, що використовується клінічними сканерами.

• Implicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2)
• Explicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2.1)
• JPEG без втрат (1.2.840.10008.1.2.4.70)
• JPEG Extended 12-bit (використовується стоматологічним КПКТ i-CAT)
• RLE Lossless
• 8-бітні, 12-бітні та 16-бітні піксельні дані
• Фотометричні інтерпретації MONOCHROME1 і MONOCHROME2

NIfTI (наукові / конвертовані знімки)

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) — формат, що використовується більшістю дослідницьких та постобробних інструментів. Якщо ваш знімок проходив через конвеєр, як-от FreeSurfer або fastMRI, ймовірно, у вас є файл NIfTI.

• .nii — нестиснений NIfTI-том
• .nii.gz — NIfTI, стиснутий GZIP (найпоширеніший)

Що зазвичай містить дослідження зображень коліна

Типове амбулаторне направлення на коліно дає кілька серій, а не одне зображення. Рентгенологи спираються на сагітальні та корональні послідовності протонної щільності з жировою сатурацією, щоб простежити розриви меніска й поверхні хряща, тоді як аксіальна серія протонної щільності охоплює пателофеморальний суглоб і борозну стегнової кістки. Послідовності T2 і STIR виявляють набряк кісткового мозку після травми з підворотом або удару плато великогомілкової кістки, а T1-зважена серія — стандартний спосіб перевірити цілісність трансплантата й сигнал кісткового мозку через кілька місяців після реконструкції ПХЗ. Те, чи знято дослідження на 1,5T чи 3T, впливає на контраст і шум, а не на формат файлу — обидва варіанти приходять як звичайний DICOM, і саме послідовності з пригніченням жиру (часто позначені на диску як «PD FS») зазвичай першими читає хірург-ортопед при травмі меніска чи зв'язки.

Серії звичайних рентгенограм так само поширені в цій папці. Стоячий знімок з навантаженням в АП-проєкції та знімок за методом Розенберга в положенні згинання виявляють звуження суглобової щілини, яке приховав би скан лежачи, аксіальний знімок (skyline/merchant) виокремлює пателофеморальний суглоб, а за бічним знімком хірург вимірює висоту надколінка. Коли потрібно картувати перелом плато великогомілкової кістки перед фіксацією, або коли хірургу потрібна точна позиція тунелю після реконструкції зв'язки, до папки зазвичай додається окрема КТ коліна поряд з МРТ. Багато таких післяопераційних КТ використовують реконструкцію зі зменшенням металевих артефактів, щоб зберегти читабельність кістки навколо пластини чи тотального ендопротеза. МРТ, рентген і КТ — усе це DICOM під капотом, і наш переглядач відкриває кожен із них однаково.

Як дослідження коліна зазвичай потрапляє до вас

Більшість досліджень коліна виходять із діагностичного центру в одному з трьох форматів. Лікарняні CD і DVD досі постачаються з файлом-індексом DICOMDIR поруч із папками пронумерованих зрізів — перетягніть усю папку диска в переглядач, і він прочитає DICOMDIR, щоб визначити, яка серія є якою. Пацієнтські портали частіше дають один ZIP-архів, що об'єднує всі серії з візиту; наш переглядач розпаковує цей архів локально, не надсилаючи його нікуди. Якщо ваш хірург прогнав скан через дослідницький або постобробний конвеєр, у вас натомість можуть бути експорти NIfTI — один об'єм на серію, з видаленими оригінальними метаданими DICOM. Незалежно від формату, коли кілька серій об'єднані разом, сагітальний стек протонної щільності зазвичай варто завантажувати першим, оскільки більшість читань меніска й хряща базуються саме на ньому. Іноді клініка надсилає одну серію електронною поштою як вкладення або дає USB-накопичувач замість диска — переглядач обробляє їх так само, як папку з CD, оскільки самі файли DICOM ідентичні незалежно від носія, на якому вони подорожували.

Товщина зрізу та 3D-рендеринг для дослідження коліна

Чи вдасться серії коліна чисто реконструюватися у 3D або в іншій площині, залежить від способу отримання знімків, а не від розширення файлу. Звичайна клінічна МРТ коліна зазвичай нарізається зрізами з кроком 3–4 міліметри з невеликими проміжками між ними — цього достатньо для читання в початковій площині зображення, але це дає блоковий, «сходинковий» об'єм при переформатуванні чи 3D-рендерингу. Тонкі, справді ізотропні послідовності поводяться інакше: 3D DESS та послідовності для картування хряща, такі як CUBE чи SPACE, отримують із субміліметровим кроком у всіх напрямках, тому вони реконструюються у гладкі сагітальні, коронарні та аксіальні зображення й добре виглядають у об'ємному рендерері. Платою за це є час сканування: ізотропна 3D-послідовність триває довше за стандартну 2D-послідовність швидкого спін-луна, тому багато клінічних протоколів досі поєднують товстозрізову 2D сагітальну PD-послідовність з однією тонкою ізотропною послідовністю, замість того щоб отримувати все з високою роздільною здатністю. Один рентгенівський знімок коліна, навпаки, є однією пласкою 2D-проєкцією — глибини для реконструкції немає, тож він відображається як зображення, а не як об'єм, який можна обертати, незалежно від способу експорту.

Сумісність за одним поглядом

Посібники: приватний перегляд і 3D-рендеринг досліджень коліна

Коли дослідження коліна все одно не відкривається

Кілька видів колінних досліджень досі можуть спантеличити будь-який браузерний переглядач. Зашифровані лікарняні диски — переважно зі старіших європейських систем PACS — потребують незашифрованої копії від процедури видачі медичних записів вашого діагностичного центру, перш ніж будь-який переглядач, включно з нашим, зможе їх прочитати. МРТ коліна, розділену на два диски через те, що сагітальна й аксіальна серії не вмістилися на одному CD, варто об'єднати в один ZIP перед завантаженням, щоб переглядач міг зіставити серії з обох частин. Дослідження, анонімізовані перед передачею вам — з видаленим із заголовка DICOM іменем пацієнта та датою народження, — все одно відкриваються нормально, оскільки переглядачу потрібні лише піксельні дані та геометрія зображення, а не поля ідентифікації. Якщо серія все ще не завантажується, перевірте, що ви завантажили саме папку DICOM — з DICOMDIR і пронумерованими файлами зрізів, — а не просто вбудовану у диск програму-переглядач Windows.