Quais formatos de arquivo abrem no nosso visualizador de ressonância magnética e raio-X do joelho

Formatos de arquivo compactado

Se o seu exame veio em um único arquivo compactado grande, solte-o diretamente no visualizador — nós o descompactamos no seu navegador.

• ZIP — o formato mais comum em CDs de hospitais e downloads de portais do paciente
• TAR — comum em conjuntos de dados de pesquisa
• .tar.gz e .tgz — TAR + compactação GZIP

Sintaxes de transferência DICOM

O formato técnico usado para codificar os dados de pixel dentro de um arquivo DICOM. Nosso visualizador decodifica todas as sintaxes de transferência comuns usadas por scanners clínicos.

• Implicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2)
• Explicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2.1)
• JPEG Lossless (1.2.840.10008.1.2.4.70)
• JPEG Extended 12-bit (usado em TCFC odontológica i-CAT)
• RLE Lossless
• Dados de pixel de 8, 12 e 16 bits
• Interpretações fotométricas MONOCHROME1 e MONOCHROME2

NIfTI (pesquisa / exames convertidos)

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) é o formato usado pela maioria das ferramentas de pesquisa e pós-processamento. Se você passou seu exame por um pipeline como FreeSurfer ou fastMRI, provavelmente tem um arquivo NIfTI.

• .nii — volume NIfTI não compactado
• .nii.gz — NIfTI compactado em GZIP (o mais comum)

O que um exame de imagem do joelho costuma conter

Um encaminhamento ambulatorial típico para o joelho gera várias séries, e não uma única imagem. Os radiologistas se apoiam em sequências sagitais e coronais ponderadas em densidade de prótons com saturação de gordura para acompanhar lesões meniscais e superfícies de cartilagem, enquanto uma série axial em densidade de prótons cobre a articulação patelofemoral e o sulco troclear. As sequências ponderadas em T2 e STIR destacam o edema da medula óssea após uma lesão por torção ou uma contusão do platô tibial, e uma série ponderada em T1 é a forma padrão de verificar a continuidade do enxerto e o sinal da medula meses após uma reconstrução do LCA. Se o exame foi feito em 1,5 T ou 3 T, muda o contraste e o ruído, não o formato do arquivo — ambos chegam como DICOM comum, e as sequências com supressão de gordura (muitas vezes rotuladas como “PD FS” no disco) costumam ser as que o cirurgião de joelho lê primeiro para lesões meniscais ou ligamentares.

Séries de radiografias simples são igualmente comuns nesta pasta. Uma incidência AP em pé com apoio de peso e uma incidência de Rosenberg em flexão revelam a redução do espaço articular que um exame deitado esconderia, uma incidência axial da patela (skyline ou Merchant) isola a articulação patelofemoral, e a incidência lateral é a que o cirurgião usa para medir a altura da patela. Quando uma fratura do platô tibial precisa ser mapeada antes da fixação, ou quando o cirurgião precisa da posição exata do túnel após uma reconstrução de ligamento, uma tomografia computadorizada dedicada do joelho geralmente se junta à pasta ao lado da ressonância magnética. Muitas dessas tomografias pós-operatórias usam uma reconstrução com redução de artefatos metálicos para manter legível o osso ao redor de uma placa ou de uma prótese total de joelho. Ressonância magnética, raio-X e tomografia computadorizada são todos DICOM por baixo, e nosso visualizador abre cada um deles da mesma forma.

Como um exame de joelho costuma chegar até você

A maioria dos exames de joelho sai do centro de imagem em uma de três formas. CDs e DVDs emitidos por hospitais ainda trazem um arquivo de índice DICOMDIR junto a pastas de cortes numerados — solte a pasta inteira do disco no visualizador e ele lê o DICOMDIR para descobrir qual série é qual. Os portais do paciente costumam entregar um único arquivo ZIP com todas as séries da consulta; o nosso descompacta esse arquivo localmente, sem enviá-lo para lugar nenhum. Se o seu cirurgião passou o exame por um fluxo de pesquisa ou pós-processamento, você pode ter exportações NIfTI — um volume por série, sem os metadados DICOM originais. Qualquer que seja o formato, quando várias séries vêm juntas, a pilha sagital em densidade de prótons costuma ser a que vale carregar primeiro, pois a maioria das leituras de menisco e cartilagem se baseia nela. Ocasionalmente, uma clínica envia uma única série por e-mail como anexo ou entrega um pendrive em vez de um disco — o visualizador trata esses casos da mesma forma que uma pasta de CD, pois os arquivos DICOM são idênticos, seja qual for o meio em que viajaram.

Espessura dos cortes e renderização 3D em um exame de joelho

Se uma série de joelho é reconstruída corretamente em 3D ou em outro plano depende de como foi adquirida, não da extensão do arquivo. Uma ressonância magnética de joelho clínica de rotina costuma ter cortes espaçados de 3 a 4 milímetros, com pequenas lacunas entre eles — adequado para leitura no plano de imagem original, mas gera um volume em blocos e degraus quando reformatado ou renderizado em 3D. Sequências finas e realmente isotrópicas se comportam de forma diferente: 3D DESS e sequências de mapeamento de cartilagem como CUBE ou SPACE são adquiridas com resolução submilimétrica em todas as direções, por isso se reconstroem em visões sagitais, coronais e axiais suaves e se saem bem no renderizador volumétrico. A contrapartida é o tempo de exame: uma sequência 3D isotrópica leva mais tempo para ser adquirida do que uma sequência 2D padrão de spin-eco rápido, e por isso muitos protocolos clínicos ainda combinam uma DP sagital 2D de cortes espessos com uma única sequência isotrópica fina, em vez de adquirir tudo em alta resolução. Já uma única radiografia do joelho é uma projeção 2D plana — não há profundidade a reconstruir, então ela é exibida como uma imagem e não como um volume que pode ser girado, não importa como tenha sido exportada.

Compatibilidade em resumo

Guias: visualização privada e renderização 3D para exames do joelho

Quando um exame de joelho ainda não abre

Alguns exames de joelho ainda causam problemas em qualquer visualizador no navegador. CDs hospitalares criptografados — principalmente de sistemas PACS europeus mais antigos — precisam de uma cópia sem criptografia, obtida pelo processo de liberação de registros do seu centro de imagem, antes que qualquer visualizador, inclusive o nosso, consiga lê-los. Uma ressonância magnética de joelho dividida em dois discos porque as séries sagital e axial não couberam em um único CD deve ser combinada em um único ZIP antes de você soltá-la aqui, para que o visualizador consiga associar as séries das duas metades. Exames anonimizados antes de chegarem a você — com o nome do paciente e a data de nascimento removidos do cabeçalho DICOM — abrem normalmente, pois o visualizador só precisa dos dados de pixel e da geometria da imagem, não dos campos de identificação. Se uma série ainda não carregar, verifique se o que você soltou é a própria pasta DICOM — com seu DICOMDIR e os arquivos de cortes numerados — e não apenas o programa visualizador para Windows que vem no disco.