Quali formati di file si aprono nel nostro visualizzatore di RMN e radiografie del ginocchio

Formati archivio

Se la scansione è arrivata come un unico file compresso, trascinarlo direttamente nel visualizzatore — verrà decompresso nel browser.

• ZIP — il formato più comune su CD ospedalieri e download dal portale pazienti
• TAR — comune per i dataset di ricerca
• .tar.gz e .tgz — compressi TAR + GZIP

Sintassi di trasferimento DICOM

Il formato tecnico utilizzato per codificare i dati pixel all'interno di un file DICOM. Il nostro visualizzatore decodifica tutte le transfer syntax comuni utilizzate dagli scanner clinici.

• Implicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2)
• Explicit VR Little Endian (1.2.840.10008.1.2.1)
• JPEG Lossless (1.2.840.10008.1.2.4.70)
• JPEG Extended a 12 bit (usato da i-CAT dental CBCT)
• RLE Lossless
• Dati pixel a 8, 12 e 16 bit
• Interpretazioni fotometriche MONOCHROME1 e MONOCHROME2

NIfTI (ricerca / scansioni convertite)

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) è il formato utilizzato dalla maggior parte degli strumenti di ricerca e post-elaborazione. Se la scansione è stata elaborata attraverso una pipeline come FreeSurfer o fastMRI, probabilmente si dispone di un file NIfTI.

• .nii — volume NIfTI non compresso
• .nii.gz — NIfTI compresso con GZIP (il più comune)

Cosa contiene di solito uno studio di imaging del ginocchio

Un tipico invio ambulatoriale per il ginocchio produce diverse serie anziché un'unica immagine. I radiologi si affidano alle sequenze sagittali e coronali a densità protonica con soppressione del grasso per tracciare lesioni meniscali e superfici cartilaginee, mentre una serie assiale a densità protonica copre l'articolazione femoro-rotulea e il solco trocleare. Le sequenze T2 e STIR evidenziano l'edema midollare osseo dopo un trauma torsionale o una contusione del piatto tibiale, e una serie T1 è il metodo standard per verificare la continuità dell'innesto e il segnale midollare mesi dopo una ricostruzione del LCA. Che lo studio sia stato acquisito a 1,5T o 3T cambia contrasto e rumore, non il formato del file — entrambi arrivano come normale DICOM, e le sequenze con soppressione del grasso (spesso etichettate “PD FS” sul disco) sono di solito ciò che un chirurgo del ginocchio legge per primo per lesioni meniscali o legamentose.

Le serie di lastre standard sono altrettanto comuni in questa cartella. Una proiezione AP in piedi in carico e una proiezione Rosenberg in flessione rivelano un restringimento dello spazio articolare che una scansione supina nasconderebbe, una proiezione skyline o merchant isola l'articolazione femoro-rotulea, e una proiezione laterale è quella da cui un chirurgo misura l'altezza rotulea. Quando una frattura del piatto tibiale deve essere mappata prima della fissazione, o quando un chirurgo ha bisogno della posizione esatta del tunnel dopo una ricostruzione legamentosa, di solito una TC dedicata del ginocchio si aggiunge alla cartella accanto alla RMN. Molte di queste TC post-operatorie usano una ricostruzione con riduzione degli artefatti metallici per mantenere leggibile l'osso intorno a una placca o a una protesi totale di ginocchio. RMN, radiografia e TC sono tutte DICOM alla base, e il nostro visualizzatore le apre tutte allo stesso modo.

Come uno studio del ginocchio di solito arriva a lei

La maggior parte degli studi del ginocchio lascia il centro di imaging in una di tre forme. I CD e DVD rilasciati dagli ospedali arrivano ancora con un file indice DICOMDIR accanto a cartelle di slice numerate — trascini l'intera cartella del disco nel visualizzatore e questo legge il DICOMDIR per capire quale serie è quale. I portali pazienti più spesso forniscono un unico archivio ZIP che raggruppa ogni serie della visita; il nostro lo estrae localmente invece di inviarlo altrove. Se il suo chirurgo ha fatto passare la scansione attraverso una pipeline di ricerca o post-elaborazione, potrebbe invece avere esportazioni NIfTI — un volume per serie, con i metadati DICOM originali rimossi. Qualunque sia la forma, quando più serie sono raggruppate insieme lo stack sagittale a densità protonica è di solito quello che vale la pena caricare per primo, poiché la maggior parte delle letture meniscali e cartilaginee si basa su di esso. Occasionalmente una clinica invia via email una singola serie come allegato o consegna una chiavetta USB invece di un disco — il visualizzatore le tratta allo stesso modo di una cartella da CD, poiché i file DICOM stessi sono identici indipendentemente dal supporto su cui hanno viaggiato.

Spessore delle slice e rendering 3D per uno studio del ginocchio

Se una serie del ginocchio si ricostruisce bene in 3D o su un piano diverso dipende da come è stata acquisita, non dalla sua estensione di file. Una RMN clinica di routine del ginocchio viene tipicamente sezionata a 3-4 millimetri di distanza con piccoli spazi tra le slice — adatta per la lettura sul piano di acquisizione originale, ma produce un volume a gradini quando viene riformattata o renderizzata in 3D. Le sequenze sottili e realmente isotropiche si comportano diversamente: il 3D DESS e le sequenze di mappatura cartilaginea come CUBE o SPACE vengono acquisite sub-millimetriche in ogni direzione, quindi si ricostruiscono in viste sagittali, coronali e assiali lisce e reggono bene nel renderer volumetrico. Il compromesso è il tempo di scansione: una sequenza 3D isotropica richiede più tempo di acquisizione rispetto a una standard sequenza 2D fast spin-echo, motivo per cui molti protocolli clinici combinano ancora una sagittale PD 2D a slice spesse con una singola sequenza sottile isotropica invece di acquisire tutto ad alta risoluzione. Una singola radiografia del ginocchio, al contrario, è un'unica proiezione 2D piatta — non c'è profondità da ricostruire, quindi viene visualizzata come un'immagine e non come un volume ruotabile, indipendentemente da come è stata esportata.

Compatibilità in sintesi

Guide: visualizzazione privata e rendering 3D per studi del ginocchio

Quando uno studio del ginocchio continua a non aprirsi

Alcuni studi del ginocchio mettono ancora in difficoltà qualsiasi visualizzatore basato su browser. I CD ospedalieri criptati — perlopiù di vecchi sistemi PACS europei — richiedono una copia non criptata ottenuta tramite la procedura di rilascio referti del centro di imaging, prima che qualsiasi visualizzatore, incluso il nostro, possa leggerli. Una RMN del ginocchio suddivisa su due dischi perché le serie sagittali e assiali non entravano su un solo CD dovrebbe essere unita in un unico file ZIP prima di caricarla, in modo che il visualizzatore possa abbinare le serie tra le due metà. Gli studi anonimizzati prima di essere consegnati — con nome del paziente e data di nascita rimossi dall'intestazione DICOM — si aprono comunque correttamente, poiché il visualizzatore necessita solo dei dati dei pixel e della geometria di imaging, non dei campi identificativi. Se una serie continua a non caricarsi, verifichi di aver trascinato la cartella DICOM stessa — con il suo DICOMDIR e i file numerati delle slice — e non solo il programma visualizzatore Windows incluso nel disco.